O sorteio realizado em Nyon, na Suíça, ditou que o SC Braga vai enfrentar o vencedor da eliminatória entre o Lugano, da Suíça, e o Cluj, da Roménia, caso consiga eliminar o Levski Sofia na 2.ª pré-eliminatória.
Os jogos da 3.ª pré-eliminatória estão marcados para 7 de agosto (primeira mão) e 14 de agosto (segunda mão). Caso o SC Braga supere esta ronda, terá ainda de ultrapassar um play-off (sorteio a 4 de agosto) para se juntar ao FC Porto na fase de grupos da Liga Europa 2025/26. Na época passada, os minhotos passaram por três rondas preliminares para se qualificarem para a fase de grupos da prova, da qual não conseguiram avançar, terminando na 25.ª posição. O Braga será cabeça de série neste sorteio, dado que é um dos clubes com maior ranking na competição, sendo apenas superado pelo Shakhtar Donetsk nesse parâmetro. Caso elimine o Levski Sofia, os bracarenses jogarão a primeira mão fora de casa, em 7 de agosto, e a segunda em Braga, no dia 14 de agosto.